自从花之魔法使玛丽贝鲁（本多知惠子配音）带着她的精灵丹伯林（坂本千夏配音）来了之后，百合（こおろぎさとみ配音）和小健（折笠爱配音）姐弟两个变得活泼多了。玛丽贝鲁是个神奇有魔力的花仙少女，她的朋友唐唐（菲尼克斯火鸟）的生日快到了，她用魔法带领白合与小健来到了妖精和花魔法使的国度花魔法界，给唐唐过生日，这里的世界像仙境一般滨彩斑斓像花的海洋一样漂亮。唐唐已是五百岁的老爷爷了，菲尼克斯每五百年重生一回，自从地球诞生后，守候着地球上所有生物使它们变得有灵性的就是菲尼克斯。唐唐需要人类持有的菲尼克斯钥匙，才能重生，但它接收了吉特的副钥匙变成了恶魔之鸟，这样地球在五百年之内就会变成黑暗的世界了。玛丽贝鲁用魔法香水带领着百合和小健他们飞了起来，去寻找正钥匙去了......

双叶翔太郎（土屋神叶配音）是一名刚刚升上高中的校园新鲜人，初三那年夏天，因为被苍高男子艺术体操社的表演所吸引，翔太郎选择考入这所学校，并且加入了体操社，在这里，他结识了一群志同道合的伙伴们。

铁剑（高山南配音）奉父之命潜心钻研剑道，在比赛场上遇见了一生的宿敌鬼丸猛（堀川亮配音），几番较量之下，鬼丸猛成为了铁剑的手下败将，不甘心的他被风神附体，得到了绝世珍宝风神剑。这边厢，铁剑亦得到了同样拥有强大力量的雷神剑，鬼丸猛一心想要夺走雷神剑，实现自己双剑合璧统治地球的野心，然而却总是不敌铁剑。

　　虽然涅吉（佐藤利奈配音）只有10岁，但他强大的魔法能力使得他足以担负起任教麻帆良学院的重任，只是，性格有些害羞又未经人事的涅吉，要他面对班上31名年长且清纯可爱的女生，这样真的没问题吗？　　每一个魔法使的身边，都会存在一个保护大的勇士，两人之间要签订契约，生死与共。而一直没有勇士相伴的涅吉，居然在阴差阳错之下，和自己的学生，巨力系少女神乐坂明日菜（神田朱未配音）签订了契约。除此之外，情报通朝仓和美（笹川亚矢奈配音），文学少女绫濑夕映（桑谷夏子配音），阴阳师近卫木乃香（近卫木乃香配音），这些女孩子们的出现，也为涅吉惊险刺激的生活增添了一份欢乐。

　　所谓的“虫”，是一种超越了科学解释范畴而存在的邪恶生物。它们专门附身在心怀梦想的少男少女身上，令他们拥有能够使用超能力的特异功能，政府称他们为“附虫者”。当附虫者们为了完成自己的梦想而使用超能力时，便会在社会中制造出许多怪异的景象，引起市民的恐慌。　　为了应对附虫者的存在，政府设立了名为“特别保护环境事务局”的机构，该机构负责监视附虫者，以及消灭虫，而身上的虫被消灭后，附虫者则会变为“缺陷者”。讽刺的是，在机构中供职的人们，他们本身亦是附虫者。在不断地和虫战斗的过程中，他们也在一步一步地接近他们的梦想。